La biologie structurale des interactions protéine-acide nucléique est à certains égards un domaine mature et à d’autres à ses balbutiements. Les structures à haute résolution des complexes protéine-ADN ont été étudiées depuis le milieu des années 1980, et un vaste éventail de ces structures a maintenant été déterminé, mais des structures surprenantes et nouvelles apparaissent encore assez fréquemment. Les structures à haute résolution des complexes protéine-ARN étaient relativement rares jusqu’à la dernière décennie. Propulsé par les progrès technologiques ainsi que par la prise de conscience de l'importance de l'ARN pour la biologie, le nombre d'exemples de structures a explosé ces dernières années. De nouvelles connaissances sont maintenant obtenues à partir d’études comparatives qui n’ont été rendues possibles que récemment en raison de la taille de la base de données, ainsi que d’études biochimiques et biophysiques minutieuses. En raison de l’explosion de la recherche dans ce domaine, il n’est plus possible de rédiger une revue complète. Au lieu de cela, les articles de synthèse actuels ont tendance à se concentrer sur des sous-sujets d’intérêt particuliers. Il est donc difficile pour les nouveaux arrivants dans le domaine d’acquérir une solide compréhension des bases. L’un des objectifs de ce livre est donc de fournir des discussions approfondies sur les principes fondamentaux des interactions protéine-acide nucléique, ainsi que d’illustrer ces principes fondamentaux avec des exemples actualisés et fascinants pour ceux qui possèdent déjà une certaine familiarité avec le domaine. Le livre vise également à combler le fossé entre les vues de l’ADN et de l’ARN de la reconnaissance des acides nucléiques et des protéines, qui sont souvent traitées comme des domaines distincts. Cependant, il s’agit d’une fausse dichotomie, car les interactions protéine-ADN et protéine-ARN partagent de nombreux principes généraux. Ce livre comprend donc des exemples pertinents des deux côtés et encadre les discussions sur les principes fondamentaux en termes qui sont pertinents pour les deux. La monographie aborde l’étude des interactions protéine-acide nucléique de deux manières distinctes. Tout d’abord, les interactions ADN-protéine et ARN-protéine sont présentées ensemble. Deuxièmement, la première moitié du livre développe les principes de la reconnaissance protéine-acide nucléique, tandis que la seconde moitié les applique à des sujets plus spécialisés. Les deux moitiés sont illustrées par d’importants exemples de la vie réelle. La première moitié du livre développe les principes fondamentaux nécessaires à la compréhension de la fonction. Un chapitre d’introduction de la rédaction passe en revue les bases de la structure des acides nucléiques. Jen-Jacobsen et Jacobsen discutent de la façon dont les interactions avec les solvants jouent un rôle important dans la reconnaissance, illustrée par de nombreuses données thermodynamiques sur les enzymes de restriction. Marmorstein et Hong présentent la zoologie des domaines de liaison à l’ADN trouvés dans les facteurs de transcription et décrivent les stratégies de reconnaissance combinatoire utilisées par de nombreux complexes eucaryotes multiprotéiques. Deux chapitres discutent en détail de la lecture indirecte de la séquence d’ADN : Berman et Lawson expliquent les principes de base et les illustrent par des études approfondies de la CAP, tandis que dans leur chapitre sur la flexion et le compactage de l’ADN, Johnson Stella et Heiss soulignent les liens intrinsèques entre la flexion de l’ADN et la lecture indirecte. Horvath expose les principes fondamentaux de la reconnaissance des protéines de l’ADN simple brin et de l’ARN simple brin et décrit comment ils s’appliquent dans une analyse détaillée des protéines de liaison aux extrémités des télomères. Les acides nucléiques adoptent des structures plus complexes - Lilley décrit les propriétés conformationnelles des jonctions hélicoïdales et comment les protéines les reconnaissent et les clivent. Parce que l'ARN se replie facilement en raison du rôle stabilisateur de ses groupes 2''-hydroxyles, Li explique comment les protéines reconnaissent différents repliements d'ARN, y compris l'ARN duplex. Une fois les principes fondamentaux exposés, la discussion se tourne vers des exemples plus spécialisés tirés d’aspects importants du métabolisme des acides nucléiques. Schroeder explique comment les protéines chaperonnent l’ARN en réorganisant sa structure sous une forme fonctionnelle. Berger et Dong discutent de la façon dont les topoisomérases modifient la topologie de l’ADN et soulagent la tension superhélicoïdale introduite par d’autres processus tels que la réplication et la transcription. Dyda et Hickman montrent comment les transpositions de l’ADN médient la mobilité génétique, et Van Duyne explique comment les recombinases spécifiques au site coupent et collent l’ADN. Horton présente un examen complet des familles structurales et des mécanismes chimiques des nucléases de l’ADN, tandis que Li, dans sa discussion sur la reconnaissance ARN-protéine, couvre également les nucléases d’ARN. Enfin, FerrÚ-D'AmarÚ montre comment les protéines reconnaissent et modifient les transcrits d'ARN à des sites spécifiques. Le livre met également l’accent sur l’impact de la biologie structurale sur la compréhension de la façon dont les protéines interagissent avec les acides nucléiques et s’adresse aux étudiants avancés et aux scientifiques établis souhaitant élargir leurs horizons. Langue : Anglais