Une nouvelle substance mystérieuse a été découverte sur la planète lointaine, Rubicon 3. En tant que source d’énergie, on s’attendait à ce que cette substance fasse progresser considérablement les capacités technologiques et de communication de l’humanité. Au lieu de cela, la substance a provoqué une catastrophe qui a englouti la planète et les étoiles environnantes dans des flammes et des tempêtes, formant un système stellaire ardent. Près d’un demi-siècle plus tard, la même substance a refait surface sur Rubicon 3, une planète maintenant contaminée et scellée par la catastrophe. Les sociétés extraterrestres et les groupes de résistance se disputent le contrôle de la substance. Le joueur infiltre Rubicon en tant que mercenaire indépendant et se retrouve dans une lutte pour le fond avec les sociétés et autres factions.